图书介绍
生物信息学 基因和蛋白质分析的实用指南PDF|Epub|txt|kindle电子书版本下载
- （美）Andreas D.Baxevanis，（美）B.F.Francis Ouellette著；李衍达，孙之荣等译 著
- 出版社： 北京：清华大学出版社
- ISBN：7302039976
- 出版时间：2000
- 标注页数：336页
- 文件大小：43MB
- 文件页数：351页
- 主题词：
PDF下载
下载说明
生物信息学 基因和蛋白质分析的实用指南PDF格式电子书版下载
下载的文件为RAR压缩包。需要使用解压软件进行解压得到PDF格式图书。建议使用BT下载工具Free Download Manager进行下载,简称FDM(免费,没有广告,支持多平台）。本站资源全部打包为BT种子。所以需要使用专业的BT下载软件进行下载。如BitComet qBittorrent uTorrent等BT下载工具。迅雷目前由于本站不是热门资源。不推荐使用！后期资源热门了。安装了迅雷也可以迅雷进行下载！
（文件页数 要大于 标注页数，上中下等多册电子书除外）
注意：本站所有压缩包均有解压码： 点击下载压缩包解压工具
图书目录
1 因特网与生物学家1
1.1 因特网基础1
1.2 与因特网连接3
1.3 电子邮件4
1.4 文件传输协议6
1.5 GOPHER8
1.6 万维网9
参考文献15
2 GenBank序列数据库16
2.1 简介16
2.2 一级和二级数据库18
2.3 格式与内容：计算机与人19
2.4 数据库21
2.5 剖析GenBank Flatile21
2.6 小结31
附录2.1 GenBank记录的例子32
附录 数据库文件格式32
参考文献32
附录2.2 ASN.1记录的例子34
附录2.3 EMBL记录的例子41
附录2.4 GenBank总结文件的例子43
3 结构数据库46
3.1 简介46
3.2 PDB：Brookhaven国家实验室蛋白质数据库49
3.3 MMDB：NCBI的分子建模数据库55
3.4 结构文件格式57
3.5 可视结构信息显示58
3.6 数据库结构浏览器64
3.7 不能查找出版的结构吗？65
参考文献66
专题论文68
4 应用GCG进行序列分析69
4.1 简介69
4.3 Wisconsin Package使用的数据库70
4.2 Wisconsin Package70
4.4 SeqLab环境71
4.5 用操作和Wisconsin Package程序分析序列74
4.6 观察输出76
4.7 监视程序执行过程并解决问题77
4.8 给序列加注释并在SeqLab Editor中图形化显示注释78
4.9 在SeqLab Editor中保存序列79
4.10 在SeqLab中可以实现的分析实例79
4.11 引人非Wisconsin Package组件的程序扩展SeqLab84
参考文献85
附录86
5 生物数据库的信息检索91
5.1 检索数据库条目：检索服务器(Retrieve服务器)91
5.2 集成信息检索：ENTREZ系统94
5.3 集成的信息访问：查询服务器105
5.4 NCBI之外的序列数据库107
5.5 医学数据库109
参考文献110
6 NCBI数据模型112
6.1 简介112
6.2 出版物116
6.3 SEQIDS：名称中包含了什么？118
6.4 BIOSEQ：生物序列121
6.5 BIOSEQSETS：序列集合124
6.6 Seq-annot:序列的注释属性125
6.7 SEQ-DESCR：序列的描述129
6.8 模型的使用129
6.9 小结131
参考文献131
7 序列比对和数据库搜索133
7.1 简介133
7.2 序列比对的进化基础133
7.3 蛋白质的模块性质135
7.4 最佳比对方法138
7.5 取代分和空位处罚139
7.6 比对的统计学显著性142
7.7 数据库中的相似性搜索143
7.8 FASTA146
7.9 BLAST146
7.10 低复杂度区域152
7.11 重复元件154
7.12 小结156
参考文献156
8 多序列比对的实际应用160
8.1 渐进比对方法161
8.2 模体和模式165
8.3 演示方法170
参考文献174
9 系统发育分析175
9.2 系统发育数据分析：比对，建立取代模型，建立进化树以及进化树评估176
9.1 系统发育模型的组成176
9.3 建立数据模型(比对)177
9.4 决定取代模型183
9.5 建树方法190
9.6 进化树搜索195
9.7 确定树根196
9.8 评估进化树和数据197
9.9 系统发育软件201
9.10 一些简单的实际的考虑208
参考文献211
10 利用核酸序列的预测方法216
10.1 框架216
10.2 遮蔽重复DNA217
10.3 数据库搜索218
10.4 密码子偏好的检测219
10.5 探查DNA中的功能性位点220
10.6 复合的基因语法分析222
10.8 未来的展望225
10.7 搜寻LRNA基因225
参考文献227
11 利用蛋白质序列的预测方法231
11.1 基于组成的蛋白质辨识232
11.2 基于序列的物理性质234
11.3 二级结构和折叠类型236
11.4 特殊结构或结构特征241
11.5 三级结构246
参考文献247
12 鼠类和人类公用物理图谱数据库漫游251
12.1 物理图谱的类型252
12.2 大型公用数据库中的基因组范围图谱254
12.3 个体来源的基因组范围图谱259
12.4 特定人类染色体图谱272
12.5 鼠类图谱来源275
参考文献278
13.1 ACEDB的一般特点280
13 ACEDB：基因组信息数据库280
13.2 ACEDB中的序列分析285
13.3 多种分析功能293
14 提交DNA序列到数据库297
14.1 简介297
14.2 提交到哪儿？298
14.3 提交什么内容？298
14.4 如何提交到万维网301
14.5 如何用Sequin提交306
14.6 EST／STS／GSS324
14.7 基因组中心326
14.8 更新326
14.9 结论性的评价327
参考文献329
附录1 词汇330
附录2 样本序列文件格式334