图书介绍
生物信息学中计算机技术应用PDF|Epub|txt|kindle电子书版本下载
- 陈绮编著 著
- 出版社： 北京：电子工业出版社
- ISBN：9787121107313
- 出版时间：2010
- 标注页数：220页
- 文件大小：11MB
- 文件页数：231页
- 主题词：计算机应用－生物信息论
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图书目录
第1章 绪论1
1.1引言1
1.2生物信息学2
1.2.1生物信息学产生的背景2
1.2.2生物学数据库4
1.2.3生物信息学的主要研究内容4
1.2.4与生物信息学关系密切的数学领域7
1.2.5与生物信息学密切相关的计算机科学技术8
1.2.6生物信息学工业8
1.3生物信息学中的计算机技术应用9
1.4蛋白质结构模型16
1.5生物系统背景知识18
1.6本书研究的内容36
1.7本书的组织结构38
1.8本章小结40
第2章 生物信息学中的结构比较41
2.1结构比对42
2.2 VAST与DALI45
2.3全局与局部结构比较46
2.4利用数学记号进行结构比较50
2.5生物大分子表面结构的比较53
2.6本章小结55
第3章 三维结构比较56
3.1三维结构比较研究56
3.2基于体模型的比较58
3.2.1外形特点分析59
3.2.2特征提取与匹配60
3.3基于三维模型几何相似性的比较65
3.3.1基于轮廓的几何相似性比较算法66
3.3.2基于拓扑结构的几何相似性比较算法77
3.3.3基于视觉的几何相似性比较算法80
3.4三维模型相似性度量方法的分类83
3.5本章小结85
第4章 蛋白质三维结构可视化86
4.1蛋白质存储结构分析86
4.2 PDB文件中对于大分子结构的描述89
4.3 MATLAB下蛋白质三维结构可视化实现91
4.4本章小结94
第5章 建立蛋白质三维结构频谱95
5.1三维物体形状特征提取95
5.2统一坐标系的建立104
5.3小波分析106
5.4基于蛋白质α碳原子距离的多分辨频谱建立109
5.5基于统一坐标序列的蛋白质三维结构多分辨频谱建立114
5.6本章小结117
第6章 蛋白质三维结构相似性118
6.1三维模型相似性比较118
6.2灰色系统理论概述123
6.3蛋白质三维结构相似性的灰色关联分析127
6.3.1原理与方法127
6.3.2实验结果及讨论129
6.4蛋白质三维结构频谱的灰色关联分析137
6.4.1方法与步骤137
6.4.2实验结果及讨论138
6.5本章小结146
第7章 蛋白质三维结构空间复杂性147
7.1生物学中的分形147
7.2分形的概述150
7.3基于分形的蛋白质三维空间结构复杂性研究153
7.3.1原子覆盖法的碳骨架分维数计算153
7.3.2实验结果及讨论155
7.4基于结构频谱分维的蛋白质三维结构相似性比较161
7.4.1方法与步骤161
7.4.2实验结果及讨论162
7.5本章小结170
第8章 蛋白质三维结构视图系统171
8.1系统框架171
8.2系统功能172
8.3本章小结173
后记174
参考文献196