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基本原理1

1病原菌是怎样形成的？3

1.1引言3

1.2灵活基因库的组成4

1.3基因组动力学机制5

1.4以大肠杆菌为模型展示细菌的基因组优化5

1.5感染过程中基因组的可塑性7

1.6结论7

2中性粒细胞的抗菌机制13

2.1引言13

2.2募集到感染部位14

2.3吞噬作用16

2.4分泌囊泡的胞吐作用和去颗粒作用17

2.5中性粒细胞胞外陷阱19

2.6中性粒细胞功能缺陷19

2.7结论21

3幽门螺杆菌感染——炎症到癌症的路径23

3.1 引言23

3.2幽门螺杆菌诱导胃癌发生的途径23

模型33

4 A群链球菌和金黄色葡萄球菌引起的皮肤及软组织感染中宿主-病原体的关系35

4.1 引言35

4.2阳离子抗菌肽对A群链球菌和金黄色葡萄球菌皮肤感染的抗菌机制和细菌的抗药机制36

4.3白细胞和皮肤A群链球菌和金黄色葡萄球菌感染37

4.4结论45

5败血性胞外病原菌侵染脑膜的机制：以脑膜炎球菌、无乳链球菌和大肠杆菌为例54

5.1引言54

5.2细菌通过中枢神经系统的脉管系统迁移55

5.3新生儿脑膜炎60

5.4脑膜炎64

6社区获得性肺炎的两个重要病原菌：肺炎链球菌和军团菌79

6.1 背景79

6.2肺炎链球菌：一个毁灭性的病原体，同时也是一个常见的上呼吸道定植菌81

6.3嗜肺军团菌——环境存在菌，同时也造成严重散发性和流行性肺炎89

6.4结论96

7沙门菌-鼠交互作用：一个研究细菌感染的通用模型104

7.1引言104

7.2致病基因的鉴定106

7.3在体内分析基因功能108

7.4深入分析在宿主组织内细胞间的相互作用113

7.5展望115

8衣原体：从分子水平洞察治疗的新发现123

8.1 引言123

8.2衣原体：一种研究胞内宿主-病原体间相互关系的模型124

8.3一种调查感染期间宿主细胞因子作用的整体方法129

8.4我们期望从整体化的RNA干扰（RNAi）方法得到什么信息？133

8.5展望134

细菌毒力的整体研究方法145

9肠道菌群及其对内稳态的贡献147

9.1引言147

9.2胃肠道菌群的特征147

9.3肠道菌群和宿主的共生关系152

9.4结论156

10肠道屏障的解剖学和肠道内稳态建立161

10.1引言161

10.2肠道屏障的解剖学、生理学和免疫学特性161

10.3通过对菌群感知、发信号和响应建立共生关系和肠道内稳态173

10.4结论179

11通过动态影像技术在细胞、组织和器官水平探索感染过程187

11.1宿主-病原体相互作用的成像简介187

11.2感染的影像学189

11.3临床意义197

11.4未来的技术发展198

12细菌感染的物种特异性问题，如何通过试验来研究？206

12.1引言206

12.2分子方面的物种特异性207

12.3用离体的人体组织使细菌侵染模型化207

12.4体内建模和相关的动物模型的探索208

12.5在体内建模关注的焦点是病原体，而不是宿主209

12.6体内建模：使用异体移植制造“人化”动物模型210

12.7人传染病免种属特异性和“人化”动物模型的遗传操作211

12.8李斯特菌作为肠道和母-胎感染模型212

12.9化脓性链球菌感染：从定植宿主上皮屏障到全身性感染218

12.10脑膜炎奈瑟菌和脑脊髓膜炎221

12.11结语223

缩略语对照表230