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第1章 海洋微生物学概论1

1.1 海洋微生物及其研究意义1

1.2 海洋微生物学的发展历程2

1.3 海洋微生物的主要类群7

1.4 海洋微生物的主要特征10

1.5 海洋微生物的栖息环境18

主要参考文献27

复习思考题27

第2章 海洋原核生物的结构及特性29

2.1 海洋原核细胞的形态结构29

2.2 海洋原核生物的营养及生长47

2.3 海洋原核生物的能量产生过程51

2.4 海洋细菌的密度感应和生物被膜58

2.5 海洋原核生物的基因组学63

主要参考文献64

复习思考题64

第3章 海洋细菌65

3.1 细菌分类系统65

3.2 海洋细菌的主要类群67

3.3 产液菌门、热袍菌门和异常球菌-栖热菌门70

3.4 绿弯菌门、硝化螺菌门和铁还原杆菌门72

3.5 蓝细菌门和绿菌门74

3.6 变形菌门78

3.7 厚壁菌门和放线菌门97

3.8 浮霉菌门、螺旋体门和酸杆菌门100

3.9 拟杆菌门、疣微菌门、芽单胞菌门和黏胶球形菌门102

主要参考文献105

复习思考题106

第4章 海洋古菌108

4.1 古菌的分类系统108

4.2 广域古菌门110

4.3 泉生古菌门117

4.4 奇古菌门119

4.5 初生古菌门121

4.6 纳米古菌门122

4.7 其他古菌门类123

4.8 古菌细胞膜脂及应用123

主要参考文献125

复习思考题126

第5章 海洋真核微生物128

5.1 真核微生物概述128

5.2 原生动物130

5.3 真核微藻133

5.4 海洋真菌138

主要参考文献142

复习思考题143

第6章 海洋病毒144

6.1 海洋病毒的计数及形态观察145

6.2 海洋病毒的产生和消亡149

6.3 海洋病毒的多样性151

6.4 海洋病毒对生物地球化学循环的影响153

6.5 感染海洋生物的病毒154

主要参考文献161

复习思考题162

第7章 深海和极地海洋微生物163

7.1 深海微生物163

7.2 极地微生物182

7.3 海洋微生物的环境适应机制185

主要参考文献192

复习思考题193

第8章 海洋微生物在生态系统中的作用194

8.1 海洋食物网中的微食物环194

8.2 海洋微生物在生物地球化学循环国中的作用203

8.3 海洋中微生物动态变化的控制因素221

8.4 海洋微生物与环境变化224

主要参考文献226

复习思考题227

第9章 海洋环境中活的非可培养（VBNC）状态细菌228

9.1 VBNC状态细菌的发现及主要细菌类群228

9.2 诱导细菌进入VBNC状态的环境因素232

9.3 VBNC状态细菌的检测方法235

9.4 VBNC状态细菌的生物学特性238

9.5 细菌进入VBNC状态的内在机制241

9.6 VBNC状态细菌的复苏研究242

9.7 对细菌VBNC状态概念的争议248

9.8 细菌VBNC状态的理论及实际意义248

主要参考文献252

复习思考题252

第10章 鱼类的微生物病害254

10.1 病害诊断255

10.2 细菌性传染病255

10.3 鱼类传染性病害的控制269

主要参考文献285

复习思考题286

第11章 海洋微生物的开发利用287

11.1 有益菌在海水养殖中的应用288

11.2 海洋微生物产生的活性物质301

11.3 海洋微生物的环境修复312

11.4 海洋微生物与生物附着315

11.5 海洋微生物的污损和防护318

11.6 金属的微生物腐蚀及防护321

11.7 微生物对木材的腐损及防护324

11.8 海洋微生物的其他应用324

主要参考文献325

复习思考题326

第12章 海洋微生物的采样技术327

12.1 水样的采集327

12.2 泥样的采集333

12.3 检样的储存337

12.4 海洋调查船338

主要参考文献340

复习思考题340

第13章 海洋微生物的多样性研究技术341

13.1 显微镜镜检计数法341

13.2 培养计数法347

13.3 流式细胞术350

13.4 免疫学检测法352

13.5 基于PCR的分子生态技术354

13.6 荧光原位杂交技术362

13.7 环境微生物组学技术363

13.8 其他分子生物学技术365

主要参考文献366

复习思考题367

第14章 海洋微生物的分离与培养技术368

14.1 海洋异养细菌分离与培养的基础方法368

14.2 特殊海洋异养细菌的分离培养373

14.3 海洋化能自养菌的分离与培养381

14.4 海洋光能营养菌的分离与培养385

14.5 海洋古菌的分离与培养388

14.6 海洋真菌的分离与培养392

14.7 其他常见海洋微生物培养基配方393

14.8 海洋微生物培养新技术396

14.9 海洋微生物的保存方法400

主要参考文献403

复习思考题404

第15章 海洋细菌的分类与鉴定技术405

15.1 海洋细菌分类与鉴定的基本流程405

15.2 形态特征分析方法406

15.3 生理生化特征分析方法408

15.4 化学特征分析方法417

15.5 海洋细菌基因特征分析方法418

15.6 细菌快速鉴定系统423

15.7 海洋细菌新分类单元的命名及发表424

15.8 展望425

主要参考文献425

复习思考题426

第16章 现代生物技术在海洋微生物研究中的应用427

16.1 转录组学技术及其应用427

16.2 蛋白质组学技术及其应用429

16.3 代谢组学技术及其应用430

16.4 基因工程技术及应用431

16.5 基因芯片技术及应用432

16.6 基因敲除技术及应用434

16.7 合成生物学技术及应用435

16.8 基因调控技术及应用439

16.9 蛋白质定向进化技术及应用442

主要参考文献444

复习思考题445

名词索引447

微生物中文名索引454

微生物拉丁名索引460