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第一章 烟草种质资源本底多样性及性状间相关研究1

第一节 资源介绍及数据采集方法2

一、烟草资源目录2

二、数据调查方法8

三、数据处理方法9

第二节 烟草种质资源本底多样性概述9

一、形态特征9

二、农艺性状13

三、化学成分18

四、感官评吸26

第三节 不同种质类型各性状多样性比较30

一、形态性状30

二、农艺性状31

三、化学指标31

四、感官评吸指标32

第四节 烤烟和晒烟资源性状间相关分析及通径分析32

一、烤烟32

二、晒烟37

第五节 本章小结41

一、烟草种质资源本底多样性概述41

二、不同种质类型各性状多样性比较42

三、烤烟与晒烟资源性状间相关分析及通径分析42

参考文献43

第二章 烟草种质资源核心种质构建44

第一节 材料与方法45

一、材料45

二、试验设计45

三、数据调查方法45

四、数据分析46

第二节 农艺性状基因型及其与环境互作分析和基因型值预测46

第三节 基于农艺性状的核心种质构建47

一、农艺性状核心种质构建策略的筛选48

二、4种抽样比率所得核心种质50

三、核心种质农艺性状与分子标记遗传多样性51

第四节 烤烟品质性状的核心种质构建56

一、烤烟品质性状核心种质构建策略的筛选57

二、4种抽样比率所得烤烟核心种质59

三、烤烟核心种质品质性状遗传多样性59

第五节 晒晾烟品质性状核心种质构建68

一、晒晾烟品质性状核心种质构建策略的筛选68

二、4种抽样比率所得晒晾烟核心种质70

三、晒晾烟核心种质品质性状遗传多样性70

第六节 本章小结79

参考文献79

第三章 烟草种质资源抗病性研究80

第一节 材料与方法81

一、材料81

二、鉴定方法81

第二节 贵州烟草种质资源抗病性概述82

第三节 不同类型烟草抗性特征分析83

一、贵州育成烤烟种质资源83

二、贵州烤烟农家种质资源83

三、贵州省外烤烟种质资源83

四、国外烤烟种质资源84

五、贵州晒烟资源84

六、贵州省外晒烟资源84

七、雪茄烟资源84

八、白肋烟资源85

九、其他烟草种质资源85

第四节 主要病害抗源分析85

一、青枯病85

二、黑胫病88

三、根结线虫93

四、普通花叶病（TMV）95

五、黄瓜花叶病（CMV）99

六、马铃薯Y病毒（PVY）100

七、赤星病103

八、气候性斑点病105

第五节 小结105

一、鉴定规模105

二、鉴定方法105

三、鉴定结果106

四、蚜传病毒病新抗源的发现106

五、存在问题106

参考文献106

第四章 自育烤烟种质的本底多样性及育种策略107

第一节 自育烤烟种质的本底多样性107

一、材料与方法108

二、自育烤烟种质形态性状本底多样性分析108

三、自育烤烟种质农艺性状遗传多样性分析110

四、自育烤烟种质的经济性状111

五、自育烤烟新种质抗病性分析112

六、自育烤烟新种质物理检测指标112

七、自育烤烟新种质化学成分遗传多样性113

八、自育烤烟新种质评吸指标分析116

九、自育烤烟新种质创新点117

第二节 烤烟育种重要农艺和经济性状遗传参数估算118

一、材料与方法119

二、结果与分析119

三、讨论120

第三节 不同杂交育种方式对拓宽烤烟种质资源遗传多样性的影响121

一、材料与方法121

二、结果与分析123

三、小结与讨论123

第四节 烤烟品质育种早期间接选择指标的初步确立124

一、材料与方法125

二、结果与分析126

三、小结与讨论128

第五节 本章小结128

一、自育烤烟新种质是对现有烤烟种质资源的重要补充128

二、重要育种农艺和经济性状的遗传分析128

三、不同育种杂交方式对拓宽烤烟种质资源遗传多样性的影响129

四、烤烟品质育种早期间接选择指标的初步确立129

参考文献129

第五章 烟草种质资源DNA遗传多样性分析131

第一节 材料与方法132

一、试验材料132

二、DNA提取与SRAP分析138

三、数据统计与分析139

第二节 结果与分析139

一、SRAP标记的多态性分析139

二、不同亚群的遗传多样性分析152

三、遗传相似系数和遗传距离分析154

第三节 小结与讨论156

一、SRAP标记具有烟草类别特异性156

二、不同亚群间遗传多样性有差异156

三、自育烤烟种质资源有较丰富的遗传多样性157

参考文献157

第六章 烟草种质资源聚类和群体结构分析158

第一节 材料与方法158

一、试验材料158

二、DNA提取与SRAP分析158

三、数据统计与分析159

第二节 结果与分析159

一、聚类分析159

二、各亚群聚类分析184

三、基于数学模型的结构分析186

四、AMOVA分析和群体间分化196

第三节 小结与讨论197

一、烟草种质资源基本按照地域或类别聚类197

二、各亚群间聚类分析198

三、数学模型结构分析198

四、AMOVA分析与群体间遗传分化198

参考文献199

第七章 烟草亚群特异性及位点与性状间关联分析200

第一节 材料与方法200

一、试验材料200

二、DNA提取与SRAP分析200

三、数据统计与分析201

第二节 结果与分析201

一、烟草亚群间补充等位变异数分析201

二、烟草亚群特异性分析203

三、自育烤烟资源性状关联分析216

第三节 小结与讨论227

一、烟草亚群间互补等位变异数分析227

二、利用其他亚群种质资源增加自育烤烟资源等位变异对育种有重要价值228

三、拓宽自育烤烟遗传背景并利用性状关联变异位点辅助选育228

参考文献228

第八章 云烟85多叶突变性状的遗传分析与分子标记定位230

第一节 材料与方法230

一、材料230

二、杂交配组与作图群体的建立230

三、DNA提取230

四、建池与引物筛选231

五、SSR扩增231

六、SRAP扩增238

七、扩增产物的检测239

八、突变基因的定位239

第二节 结果与分析239

一、多叶突变性状的遗传239

二、引物筛选239

三、多叶突变性状的分子标记定位240

第三节 讨论241

参考文献241

第九章 烤烟种质资源DNA甲基化多样性分析与TMV抗性分子标记初步筛选243

第一节 材料与方法243

一、材料243

二、DNA提取245

三、MSAP分析245

四、数据分析246

第二节 结果与分析247

一、MSAP指纹图谱构建247

二、多态性引物筛选248

三、烤烟DNA甲基化水平分析250

四、烤烟DNA甲基化聚类分析250

五、各种质DNA甲基化特征252

六、部分种质DNA甲基化水平与表型的相关分析253

七、MSAP带型与TMV抗性相关分析255

第三节 讨论257

参考文献258

第十章 烤烟种质资源腺毛密度及其与主要品质和抗病性状的灰色关联分析260

第一节 材料与方法260

一、实验材料260

二、腺毛密度调查262

三、数据分析262

第二节 结果与分析263

一、烟叶腺毛观察263

二、腺毛密度分析264

三、烤烟腺毛密度与相关性状的灰色关联分析265

第三节 讨论265

参考文献266

第十一章 烟草诱变种质创新技术研究267

第一节 γ射线与EMS单一及复合处理对烤烟种子活力及几种主要农艺性状的诱变效应267

一、试验与方法267

二、结果与分析269

三、小结276

第二节 γ射线与NaN3单一及复合处理对烤烟种子活力及几种主要农艺性状的诱变效应276

一、试验与方法276

二、结果与分析277

三、小结284

第三节 小结与讨论285

参考文献286

第十二章 烟属植物的起源、进化与分类研究的新进展288

第一节 烟属起源与分子系统进化288

一、烟属起源、进化和分类研究主要历程288

二、烟属分子系统分类与传统分类的比较290

三、分子系统学对Goodspeed分类不明确种归属的解析297

第二节 烟属植物学分类新体系299

一、20世纪中叶前的烟属分类300

二、Goodspeed分类体系300

三、烟属新种的发现与命名301

四、Sandra Knapp对烟属中种的新划分302

第三节 小结307

参考文献308

第十三章 烟草种质资源管理系统操作手册310

一、系统界面310

二、档案管理311

三、系统管理315